Skullgirls possède une musique stupéfiante composée par la légendaire Michiru Yamane, connue pour son classique Castelvania : Symphony of the Night. C’est la première fois qu’un compositeur Japonais écrit la musique d’un jeu développé en Occident.
Combinant ses habituelles mélodies gothiques, hantées avec des influences jazz, la musique de Michiru Yamane offre une ambiance parfaite pour le monde » Déco Sombre » de Skullgirls.